La sección Matemática está formada por siete grupos de investigación que cubren un amplio espectro de temas y áreas, tanto en matemática pura como en matemática aplicada. Hay grupos más orientados al análisis como son «Análisis Numérico y Computación», «Ecuaciones Diferenciales y Análisis Armónico» y «Probabilidad y Estadística» y grupos mas orientados a la geometría y el álgebra como «Geometría Diferencial», «Teoría de Lie» y «Teoría de Números». También está el grupo de «Semántica Algebraica» orientado a la lógica matemática.
Cada grupo realiza semanalmente seminarios brindados para el público en general.
Se realiza también el seminario de alumnos semanalmente organizado por los doctorandos de los distintos grupos.
